定制物流集裝箱有冷凍集裝箱（REEFER CONTAINER），簡寫RF，掛衣集裝箱（DRESS HANGER CONTAINER），開頂集裝箱（OPEN TOP CONTAINER）簡寫OT，框架集裝箱（FLAT RACK CONTAINER）簡寫FR，罐式集裝箱（TANK CONTAINER）簡寫TK、冷藏集裝箱、平臺集裝箱（PLATFORM CONTAINER）、通風集裝箱（VENTILATED CONTAINER）、保溫集裝箱（INSULATED CONTAINER）。

開頂集裝箱是用于裝載玻璃板，鋼制品，機械等重貨，可以使用起重機從頂部裝卸，開頂箱頂部可開啟或無固定項面的集裝箱。框架集裝箱是以箱底面和四周金屬框架構成的展翼集裝箱，適用于長大、超重、輕泡貨物。罐裝集裝箱是由箱底面和罐體及四周框架構成的集裝箱，適用于液體貨物。

平臺集裝箱是裝運超限貨物的集裝箱，有一個強度很大的底盤，在裝運大件貨物時，可同時使用幾個平臺集裝箱。

計算單位：

集裝箱計算單位，簡稱：TEU，是英文Twenty Equivalent Unit的縮寫，又稱20英尺換算單位，是計算集裝箱箱數的換算單位。也稱標準箱單位。通常用來表示船舶裝載集裝箱的能力，也是集裝箱和港口吞吐量的重要統計、換算單位。

各國大部分集裝箱運輸，都采用20英尺和40英尺長的兩種集裝箱。為使集裝箱箱數計算統一化，把20英尺集裝箱作為一個計算單位，40尺集裝箱作為兩個計算單位，以利統一計算集裝箱的營運量。

在統計集裝箱數量時有的一個術語：自然箱，也稱"實物箱"。自然箱是不進行換算的實物箱，即不論是40英尺集裝箱，30英尺集裝箱，20英尺集裝箱或10英尺集裝箱均作為一個集裝箱統計。